为保障不同厂家生产的箱式变电站的兼容性，可以采取以下措施：

1、制定统一标准：相关行业应制定严格的箱式变电站技术标准，包括电气接口、通信协议、物理尺寸等方面，确保不同厂家生产的设备能够无缝对接。

2、前期测试与确认：在采购前，对候选箱式变电站进行严格的兼容性测试，确保其与其他设备的互操作性。

3、技术培训与支持：厂家应提供必要的技术培训和支持，帮助用户了解设备的配置、使用和维护方法，减少因操作不当导致的兼容性问题。

通过这些措施，可以有效保障不同厂家生产的箱式变电站的兼容性。